A pós-graduação no Programa de Alergia e Imunopatologia da FMUSP exige dedicação integral dos alunos. A maior parte dos alunos tem seus estudos financiados por bolsas de estudo distribuídas por agências de fomento como a Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo – FAPESP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior – CAPES e Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq.
Os pedidos de bolsa à FAPESP são feitos diretamente pelos orientadores sem intermediação da comissão coordenadora do programa. As bolsas de demanda social da CAPES e do CNPq são distribuídas aos alunos interessados após entrevista junto à Comissão de Bolsas deste programa. O número de contemplados depende do número de bolsas disponíveis. Os critérios de elegibilidade e classificação para as bolsas podem ser encontrados aqui.